Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb5Q02739 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms