Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms