Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabpb1Q00420 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms