Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim43bP86448 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms