Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeboxP70368 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeboxP70368 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeboxP70368 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeboxP70368 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeboxP70368 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeboxP70368 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeboxP70368 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeboxP70368 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SeboxP70368 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeboxP70368 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms