Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tgif1P70284 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgif1P70284 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms