Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms