Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad54lP70270 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms