Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms