Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcbP68404 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms