Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms