Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rps29P62274 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms