Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp46P62069 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms