Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga11P61622 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga11P61622 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms