Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms