Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppfia3P60469 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms