Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rin3P59729 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rin3P59729 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms