Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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