Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp5P56399 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms