Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nub1P54729 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms