Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacnb3P54285 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms