Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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