Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cux1P53564 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cux1P53564 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cux1P53564 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cux1P53564 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms