Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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