Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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