Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa6P50704 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms