Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms