Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkn1bP46414 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms