Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ItgavP43406 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms