Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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