Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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