Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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