Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtlP38585 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms