Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6dP35459 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms