Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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