Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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