Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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