Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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