Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms