Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa2P28309 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa2P28309 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms