Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms