Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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