Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U2af2P26369 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms