Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou2f1P25425 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou2f1P25425 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms