Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PparaP23204 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PparaP23204 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PparaP23204 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PparaP23204 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms