Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms