Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms