Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TP20293 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TP20293 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TP20293 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TP20293 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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