Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a1P19437 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a1P19437 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms