Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpraP18052 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms